物理清洗方法：
1.停止装置
慢慢的把操作压力降低，逐步停止装置。，因为如果一下子停止装置会导致装置中的压力快速的下降形成水锤，冲击对管道、压力容器以及膜元件造成一定的损伤。
2.调节阀门
首先把浓溶液的水阀门全部打开；之后把进水的阀门关闭；接着把产水阀门打开到最大。如果把关闭阀门顺序搞错了，就可能会产生背压对压力容器中的后端的膜元件造成械性的损害
3.清洗作业
首先把低压清洗泵打开；然后再慢慢的把进水阀打开，这时候一定要注意观察浓缩水流量计的流量；调节进水阀门一直调到流量和压力都达到预先设计好的值；最后在10-15分钟后慢慢地关闭进水阀门，停止进水泵。
化学清洗方法：
化学清洗方法是利用化学药剂进行清洗的，针对不同的污染物要选用不同的化学药剂，下面也会给大家介绍什么污染物选用什么化学药剂。
柠檬酸清洗
在采用柠檬酸溶液进行清洗之前，先用软化水或者 RO 产品水对膜元件进行冲洗。向清洗水箱中添加柠檬酸（白色粉末），对溶液进行连续的搅动，使柠檬酸迅速和充分溶解，使柠檬酸溶液浓度达到 2%（质量百分比）。在添加药品之前，将大块的药品敲碎，以避免对搅拌器和水泵造成损坏。
十二烷基磺酸钠(Na-SDS)清洗剂清洗
配制 0.025%（质量百分比浓度）十二烷基磺酸钠和 0.1%（质量百分比浓度）NaOH 溶液，控制溶液温度小于 30℃，其 pH 控制范围在 pH12 以内。此种方法最好作为系统的第一步化学清洗。
六聚偏磷酸钠+盐酸的清洗
向水中添加 SHMP（白色粉末），小批量逐步添加，以达到 1.0%浓度（质量百分比）溶液。使用搅拌器连续地搅拌溶液，使化学药品均匀混合。
缓慢的将盐酸（HCl）添加到 SHMP 溶液中，直到溶液的 pH 值达到 2。盐酸（HCl）是一种腐蚀性的无机酸，在处理盐酸时要注意安全规则。
溶液的 pH 值应该接近，但是要大于 2。 如果在清洗期间溶液的 pH 值升高超过 3.5，则要添加盐酸（HCl）直到 pH 值恰好大于 2。如果 pH 值降低到小于 2，使用 NaOH 进行调节。NaOH 是一种腐蚀性无机碱，在使用时要注意安全规则。
反渗透膜的清洗步骤：
1、用泵将干净、无游离氯的纯净水从特定的进水口打入压力容器中并且排放几分钟。
2、用干净的纯净水在清洗箱中配制清洗液，因为针对不同的膜或者不同的污染物需要不同的清洗液。
3、将清洗液在压力容器中循环1小时或预先设定的时间。
4、清洗完成以后，排净清洗箱并进行冲洗，然后向清洗箱中充满干净的产品水以备下一步冲洗。
5、用泵将干净、无游离氯的产品水从清洗箱(或相应水源)打入压力容器中并排放几分钟。
6、在冲洗RO反渗透膜系统后，在产品水排放阀打开状态下运行反渗透系统，直到产品水清洁、无泡沫或无清洗剂(通常15-30分钟)。